Apesar de serem adjacentes, a Escola Pública de Ensino Médio Chidori e a Academia Particular Kikyo, só para meninas, parecem existir em dois mundos diferentes. Enquanto a última ostenta uma reputação imaculada e favorece alunas de famílias ricas, a primeira é um ninho para delinquentes estúpidos. Todos em Kikyo nutrem um ódio profundo por seus vizinhos de Chidori.
Rintarou Tsumugi, de dezesseis anos, é um aluno de Chidori cujo rosto intimidador faz com que as pessoas o evitem. Rintarou não se importa com isso, pois está satisfeito com seu grupo de amigos. No entanto, há algo que ele ainda não lhes contou: às vezes, ele ajuda na confeitaria de sua família.
Um dia, no trabalho, Rintarou vê uma cliente em uma mesa, mas ela sai correndo antes que ele possa falar com ela. No dia seguinte, ele recebe um pedido de desculpas da garota, Kaoruko Waguri, que explica que não fugiu por causa de sua aparência e que acredita que Rintarou é uma pessoa de bom coração. Embora não esteja acostumado com a personalidade brilhante de Kaoruko, Rintarou anseia por uma amizade. Só há um obstáculo em seu caminho: Kaoruko é uma aluna de Kikyou! Kaoru Hana wa Rin to Saku.